Aquella especie que con su presencia, ausencia, abundancia o salud general, define cuán saludable es un ecosistema en su conjunto. Los científicos pueden utilizar una especie indicadora para medir la biodiversidad global y de este modo controlar el éxito que tienen distintos proyectos de conservación. Normalmente, las especies indicadoras son muy sensibles a los cambios en su entorno. Los pingüinos de Galápagos son un ejemplo de especie indicadora.